More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2282 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2282  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 167 aa  331  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.03 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2736  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.23 
 
 		 155 aa  202  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372982  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16300  predicted rRNA methylase SpoU family  63.46 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.292915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1533  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.89 
 
 		 154 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401176  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06670  predicted rRNA methylase SpoU family  63.33 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.728557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0939  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.33 
 
 		 154 aa  195  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22350  predicted rRNA methylase SpoU family  63.46 
 
 		 158 aa  194  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.75 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1186  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68 
 
 		 179 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1213  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68 
 
 		 179 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1203  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68 
 
 		 179 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.785783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1754  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.24 
 
 		 154 aa  192  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4891  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.79 
 
 		 154 aa  191  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.723752  normal  0.0326205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.24 
 
 		 155 aa  190  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  67.1 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3003  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.56 
 
 		 153 aa  185  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13402  tRNA/rRNA methylase spoU  64.24 
 
 		 154 aa  184  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853607  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1170  putative RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.25 
 
 		 229 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0394507 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0968  hypothetical protein  52.94 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.815301  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14890  rRNA methylase, putative, group 2  60.13 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.35 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.66 
 
 		 151 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  54.67 
 
 		 154 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.32 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1538  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.85 
 
 		 170 aa  157  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  52.6 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  50.99 
 
 		 153 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  51.97 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.64 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  50.33 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.99 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  48.7 
 
 		 153 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.32 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  51.66 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.66 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  48.7 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.33 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  47.47 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.32 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.68 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  48.05 
 
 		 153 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1241  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.56 
 
 		 183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.67 
 
 		 154 aa  150  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  47.71 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.88 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.29 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.84 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  49.01 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3301  RNA methyltransferase  51.37 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.33 
 
 		 189 aa  147  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.675577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.7 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2864  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.66 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.45 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  49.34 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  49.01 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  47.71 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  46.45 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  48.68 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  49.34 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.96 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  50.65 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.96 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  50.65 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.32 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3910  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.33 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2799  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  50 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  48.03 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  46.1 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 154 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.68 
 
 		 154 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1670  RNA methyltransferase  49.33 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.32 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0973  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.77 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  47.37 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.7 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.15 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.37 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2237  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.68 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  47.44 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0422  RNA methyltransferase  48.7 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.08 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.05 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  48.08 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>