More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1213 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1213  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1186  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1203  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.785783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1533  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  90.2 
 
 		 154 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401176  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4891  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  86.18 
 
 		 154 aa  270  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.723752  normal  0.0326205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13402  tRNA/rRNA methylase spoU  81.58 
 
 		 154 aa  256  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853607  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0939  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  73.2 
 
 		 154 aa  232  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1754  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.36 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2736  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.23 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.23 
 
 		 155 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22350  predicted rRNA methylase SpoU family  63.4 
 
 		 158 aa  201  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06670  predicted rRNA methylase SpoU family  61.84 
 
 		 157 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.728557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.67 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3003  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.13 
 
 		 153 aa  185  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16300  predicted rRNA methylase SpoU family  58.82 
 
 		 155 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.292915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.67 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.78 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  56.21 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2282  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14890  rRNA methylase, putative, group 2  60.9 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1170  putative RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.63 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0394507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.32 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.66 
 
 		 151 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.26 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0968  hypothetical protein  51.97 
 
 		 220 aa  167  8e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.815301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.99 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  50 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  53.95 
 
 		 159 aa  165  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1538  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.94 
 
 		 170 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  49.02 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  49.34 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.32 
 
 		 154 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.71 
 
 		 154 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2799  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  53.16 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  49.02 
 
 		 154 aa  160  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  50.63 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  50.63 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  48.68 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  49.67 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  49.34 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  50.96 
 
 		 158 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.66 
 
 		 154 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  50.33 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 154 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.43 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.95 
 
 		 157 aa  157  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.35 
 
 		 158 aa  157  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 		 154 aa  157  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.33 
 
 		 154 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.67 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.94 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.94 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  49.67 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  50.33 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0358  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  49.06 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  50.31 
 
 		 156 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.06 
 
 		 156 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.67 
 
 		 151 aa  154  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.09 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0257  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.5 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.37 
 
 		 159 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3185  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  51.2 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.29 
 
 		 154 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.43 
 
 		 156 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  49.67 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.08 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  49.02 
 
 		 154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  49.37 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  45.96 
 
 		 162 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  47.71 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  45.96 
 
 		 162 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  45.96 
 
 		 162 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  47.44 
 
 		 157 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 154 aa  151  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  47.44 
 
 		 157 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  49.02 
 
 		 154 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 		 157 aa  151  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 		 157 aa  151  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.44 
 
 		 157 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 		 157 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.33 
 
 		 161 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  50.31 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.44 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1127  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.98 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 154 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  50.31 
 
 		 170 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  48.37 
 
 		 154 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.79 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  46.71 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.79 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3815  RNA methyltransferase  49.69 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.79 
 
 		 157 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  48 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  45.86 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  49.69 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  51.25 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>