More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_14890 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_14890  rRNA methylase, putative, group 2  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  73.03 
 
 
155 aa  217  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2736  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  71.05 
 
 
155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22350  predicted rRNA methylase SpoU family  69.28 
 
 
158 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125418  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16300  predicted rRNA methylase SpoU family  65.13 
 
 
155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.292915  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.9 
 
 
168 aa  192  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1754  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.16 
 
 
154 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1533  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.84 
 
 
154 aa  190  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401176  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0939  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.58 
 
 
154 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.82 
 
 
159 aa  185  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4891  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.84 
 
 
154 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.723752  normal  0.0326205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13402  tRNA/rRNA methylase spoU  61.84 
 
 
154 aa  184  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853607  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1186  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.9 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1213  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.9 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1203  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.9 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.785783  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06670  predicted rRNA methylase SpoU family  60.4 
 
 
157 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.728557  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1538  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.6 
 
 
170 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.63 
 
 
155 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  55.63 
 
 
155 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  60.93 
 
 
154 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.59 
 
 
154 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  55.84 
 
 
159 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.74 
 
 
163 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0968  hypothetical protein  50.3 
 
 
220 aa  169  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.815301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2282  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.92 
 
 
167 aa  168  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.15 
 
 
186 aa  168  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  54.9 
 
 
158 aa  167  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  56.41 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1170  putative RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.22 
 
 
229 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0394507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3003  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.33 
 
 
153 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.63 
 
 
157 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  54.55 
 
 
170 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  56.13 
 
 
156 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.84 
 
 
156 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.97 
 
 
154 aa  165  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  53.66 
 
 
172 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.19 
 
 
156 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.84 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  52 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.95 
 
 
161 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.48 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.33 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  54 
 
 
154 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  55.48 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  52 
 
 
154 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0358  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  54.19 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.55 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  53.29 
 
 
153 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.64 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.33 
 
 
164 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  52.63 
 
 
157 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.6 
 
 
171 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
156 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
156 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
156 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
156 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.6 
 
 
171 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0422  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
156 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  53.29 
 
 
153 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
156 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  53.29 
 
 
154 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
179 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
179 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  52.63 
 
 
153 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52 
 
 
151 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.64 
 
 
154 aa  158  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.97 
 
 
159 aa  158  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  54 
 
 
153 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  52.98 
 
 
153 aa  157  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.97 
 
 
156 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  50.33 
 
 
154 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  51.63 
 
 
154 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  54.67 
 
 
153 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.63 
 
 
158 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.33 
 
 
151 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  52.63 
 
 
154 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.67 
 
 
157 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.67 
 
 
157 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 
157 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  50.99 
 
 
154 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.63 
 
 
154 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2237  RNA methyltransferase TrmH, group 2  56.08 
 
 
168 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.63 
 
 
154 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.02 
 
 
151 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  50.67 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.67 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.67 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  50.67 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  52.26 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.33 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0257  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.97 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.67 
 
 
157 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.67 
 
 
157 aa  154  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.67 
 
 
157 aa  154  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  50.67 
 
 
154 aa  154  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  51.32 
 
 
154 aa  154  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.67 
 
 
157 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  50.67 
 
 
157 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  50 
 
 
177 aa  153  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>