More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0853 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  100 
 
 
155 aa  310  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  51.3 
 
 
163 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  52.32 
 
 
157 aa  158  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  52.94 
 
 
235 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  51.63 
 
 
202 aa  152  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  51.72 
 
 
158 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 
154 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 
174 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  48.37 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  48.68 
 
 
173 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 
174 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  48.39 
 
 
168 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  54.03 
 
 
181 aa  143  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 
167 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  56.86 
 
 
216 aa  142  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 
163 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  47.97 
 
 
172 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 
173 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 
169 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  56.21 
 
 
171 aa  138  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
169 aa  138  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
169 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 
166 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  47.89 
 
 
176 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  46.45 
 
 
169 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 
154 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 
172 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 
166 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  48.98 
 
 
169 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
178 aa  133  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  43.84 
 
 
154 aa  133  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  48.3 
 
 
169 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
168 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 
176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  48.92 
 
 
182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  46.85 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  47.18 
 
 
168 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 
170 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  43.97 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 
170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  44.06 
 
 
164 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  43.87 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 
178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  50.74 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
165 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 
170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 
165 aa  124  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
170 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 
169 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  47.95 
 
 
173 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
166 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
166 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
166 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  120  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  120  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  120  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
164 aa  120  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 
176 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  48.25 
 
 
171 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  48.59 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 
169 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>