More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0653 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0653  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 409 aa  793    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356164  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.48 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1877  RND family efflux transporter MFP subunit  54.55 
 
 		 405 aa  301  9e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.38 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.72 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  33.25 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.48 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  31.08 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.87 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.92 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.77 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  30.15 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.31 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.39 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  30.68 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  25.19 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  26.93 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  26.93 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  25.19 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.34 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  26.93 
 
 		 370 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  29.05 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  28.06 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 421 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  24.56 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  30 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  30 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  30 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  30 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.84 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  27.68 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  29.81 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.19 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  28.94 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  29.7 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  29.7 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  30 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  31.23 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  29.7 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  31.8 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.23 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  29.57 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  29.71 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 371 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 380 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 368 aa  106  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.45 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  24.19 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.95 
 
 		 479 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  27.47 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  30.38 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.72 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  29.95 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  27.51 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.32 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.44 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  27.67 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  24.59 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  22.08 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 444 aa  99.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 416 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0558  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 513 aa  99.4  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.18 
 
 		 399 aa  99.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.21 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>