268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0238 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0218  UspA domain-containing protein  95.93 
 
 		 171 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0416  UspA domain-containing protein  67.55 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0255  UspA domain-containing protein  69.54 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0420  UspA domain protein  46.75 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4458  UspA domain protein  49.35 
 
 		 200 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0969362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  45.89 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  29.93 
 
 		 292 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.65 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.46 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  31.08 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.75 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  42.7 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  27.92 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  36.46 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.45 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  45.12 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  29.93 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.38 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.01 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.94 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  35.42 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  58.7 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.28 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  32.86 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  41.54 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  36 
 
 		 303 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 294 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  29.93 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  52.08 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  38.79 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  38.79 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  38.79 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2280  universal stress protein UspA-like protein  27.15 
 
 		 277 aa  51.6  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00205289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  33.09 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  34.62 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  49.02 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.19 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  39.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  53.06 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  39.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  53.06 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  39.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  39.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.74 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  53.06 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  28.76 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  39.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  39.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  54 
 
 		 298 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  51.11 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  39.53 
 
 		 314 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  35.35 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.19 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  30.41 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.21 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  38.79 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  47.92 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.83 
 
 		 290 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  30.41 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  40 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  38.1 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  44 
 
 		 130 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  31.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  54 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  29.25 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.82 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  30.13 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>