38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2280 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2280  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 277 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00205289  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  22.65 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  23.84 
 
 		 415 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  20.64 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  29.31 
 
 		 887 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 887 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  31.16 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 883 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0218  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0228  hypothetical protein  26.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  30.07 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.75 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  26.12 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  25.18 
 
 		 154 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  26.12 
 
 		 152 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  21.65 
 
 		 307 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  28.87 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  26.71 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  27.16 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 148 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.01 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  21.91 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43350  two-component sensor KdpD  28.45 
 
 		 885 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.619422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  26.81 
 
 		 138 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  28.45 
 
 		 885 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  25.35 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  24.09 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  31.88 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  28.35 
 
 		 136 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  24.82 
 
 		 148 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.26 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 148 aa  42.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 156 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  27.03 
 
 		 152 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 151 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  27.03 
 
 		 158 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>