266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4208 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  70.38 
 
 
260 aa  341  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.09 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.45 
 
 
262 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  42.52 
 
 
262 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  43.58 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.25 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  43.53 
 
 
262 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.53 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  42.35 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.54 
 
 
262 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.96 
 
 
262 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.65 
 
 
261 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.74 
 
 
262 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  41.06 
 
 
267 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.53 
 
 
268 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.57 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.67 
 
 
254 aa  178  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.02 
 
 
263 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.1 
 
 
257 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.02 
 
 
263 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.96 
 
 
262 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.87 
 
 
267 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  40.6 
 
 
265 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.16 
 
 
254 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.68 
 
 
264 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.8 
 
 
260 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.43 
 
 
261 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.5 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  34.63 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.37 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.66 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.8 
 
 
259 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.2 
 
 
264 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.46 
 
 
266 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  41.86 
 
 
256 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  35.57 
 
 
260 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.27 
 
 
271 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  43.12 
 
 
263 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  34.88 
 
 
260 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.05 
 
 
261 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.11 
 
 
260 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.73 
 
 
259 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.11 
 
 
260 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.55 
 
 
262 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  38.11 
 
 
266 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  39 
 
 
259 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.51 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
257 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.6 
 
 
264 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  36.29 
 
 
255 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.96 
 
 
260 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.49 
 
 
259 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.24 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.36 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.47 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.8 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.08 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.5 
 
 
259 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.66 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.51 
 
 
260 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.11 
 
 
260 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.61 
 
 
264 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.45 
 
 
257 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.12 
 
 
257 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4369  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.34 
 
 
267 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455554  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.3 
 
 
264 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  36.49 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.93 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.71 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.25 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.36 
 
 
267 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.44 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.13 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.36 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.03 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.36 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.36 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  34.77 
 
 
267 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.73 
 
 
269 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.1 
 
 
260 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1787  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.8 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  34.38 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3658  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.59 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.59 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.93 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.1 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  34 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  34 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  34 
 
 
261 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.85 
 
 
267 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.63 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.94 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  32.94 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  32.94 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.04 
 
 
265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.94 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.07 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.68 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>