More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2972 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  99.21 
 
 
253 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  99.21 
 
 
253 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  72.44 
 
 
254 aa  361  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  71.26 
 
 
255 aa  335  5e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  60.78 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  59.48 
 
 
245 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  57.85 
 
 
243 aa  248  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  52.97 
 
 
238 aa  248  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  54.27 
 
 
249 aa  248  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  56.61 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  56.28 
 
 
239 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  52.05 
 
 
254 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  51.93 
 
 
247 aa  218  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.22 
 
 
283 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  53.12 
 
 
522 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
242 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
248 aa  185  8e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  37.18 
 
 
241 aa  184  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
248 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 
248 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  40.08 
 
 
248 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  43.3 
 
 
286 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
241 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  38.77 
 
 
244 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
241 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
248 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  37.83 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  38.55 
 
 
593 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  39.57 
 
 
340 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
241 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.52 
 
 
907 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  37.72 
 
 
322 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  40.09 
 
 
335 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  40.71 
 
 
328 aa  168  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.72 
 
 
327 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  39.81 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.25 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  34.58 
 
 
323 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  34.58 
 
 
255 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  44.06 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.1 
 
 
305 aa  165  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 
308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.72 
 
 
322 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  38.08 
 
 
921 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.9 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  42.11 
 
 
330 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  38.37 
 
 
929 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  39.27 
 
 
320 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  38.25 
 
 
308 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  39.81 
 
 
326 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  38.43 
 
 
906 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  39.15 
 
 
927 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  39.83 
 
 
915 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  35 
 
 
582 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 
541 aa  159  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  35.97 
 
 
914 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  34.17 
 
 
579 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  39.43 
 
 
315 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  36.04 
 
 
324 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  39.35 
 
 
326 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  39.57 
 
 
911 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  34.58 
 
 
583 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  36.82 
 
 
906 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  40 
 
 
936 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  37.78 
 
 
318 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  32.11 
 
 
589 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  36.18 
 
 
510 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  39.81 
 
 
317 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  35.98 
 
 
911 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  36.07 
 
 
257 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  40.28 
 
 
323 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  35.98 
 
 
911 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.75 
 
 
578 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  35.98 
 
 
911 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  35.98 
 
 
911 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  33.75 
 
 
578 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  34.55 
 
 
913 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  34.55 
 
 
913 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  35.98 
 
 
911 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  35.98 
 
 
911 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  33.75 
 
 
578 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  35.98 
 
 
911 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  39.11 
 
 
942 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  34.55 
 
 
913 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  33.75 
 
 
578 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
578 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
578 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  35.98 
 
 
911 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  34.55 
 
 
913 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
578 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  35.98 
 
 
911 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
578 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
578 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  40.28 
 
 
323 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>