More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2591 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 		 343 aa  665    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  57.27 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  52.13 
 
 		 338 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  36.28 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  36.16 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  35.62 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.91 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  36.31 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.26 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.08 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.81 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  35.31 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.49 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2785  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.78 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2793  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.78 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  34.06 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  29.17 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  33.13 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  29.92 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.82 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  33.02 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  33.02 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  28.82 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  33.02 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  33.02 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  33.02 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  33.02 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  33.02 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  33.02 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  29.59 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  32.72 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  32.2 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  30.79 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.18 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  29.97 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  29.34 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.27 
 
 		 293 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  31 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0363  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.51 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.631394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  30.56 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2971  formate hydrogenlyase, subunit D  30.58 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  30.67 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3037  formate hydrogenlyase subunit D  30.58 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217312 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  28.74 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3002  formate hydrogenlyase subunit D  30.58 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3053  formate hydrogenlyase subunit D  30.58 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3160  formate hydrogenlyase, subunit D  30.58 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.184477 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  29.03 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3408  F420H2 dehydrogenase subunit H  30 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00645372  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0889  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.3 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3195  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.79 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3973  formate hydrogenlyase, subunit D  29.45 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  30.09 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  26.25 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  28.83 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  28.27 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  31.68 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2847  formate hydrogenlyase, subunit D  29.79 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  30.95 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3154  formate hydrogenlyase, subunit D  29.79 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0967  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.9 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3010  formate hydrogenlyase, subunit D  29.9 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0990  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.9 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0456069 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2190  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.18 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.552986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2858  formate hydrogenlyase, subunit D  29.9 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.79 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  27.3 
 
 		 364 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  28.09 
 
 		 384 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1731  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.29 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0032732  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  28.26 
 
 		 353 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  27.68 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  27.68 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02572  hydrogenase 3, membrane subunit  29.45 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  28.57 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02537  hypothetical protein  29.45 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  28.94 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  29.51 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.22 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.74 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.03 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  30.59 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1185  NADH dehydrogenase subunit H  31.05 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.08 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1053  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.79 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  28.75 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  27.54 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2709  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.9 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  30.38 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0187  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.61 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  27.54 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  29.19 
 
 		 372 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  28.65 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.89 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  28.83 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0151  ech hydrogenase subunit B  30.86 
 
 		 287 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  29.94 
 
 		 449 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  28.22 
 
 		 372 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>