141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2197 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  100 
 
 		 330 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  52.55 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  53.92 
 
 		 331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  49.4 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  46.2 
 
 		 327 aa  288  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  38.65 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  38.46 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 		 323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  42.46 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.89 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  21.85 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  23.95 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.11 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  25.4 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4606  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  21.01 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2040  radical SAM family protein  26.64 
 
 		 421 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0108  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1155  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00303248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2234  DNA-binding protein  28.46 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.62693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  22.27 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0909  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338541  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2260  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249916  normal  0.262865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  27.72 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1713  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00398016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  28.71 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2984  hypothetical protein  26.2 
 
 		 412 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0923725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05010  Radical SAM domain protein  22.18 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  29.06 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1942  hypothetical protein  27.21 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2067  radical SAM family protein  26.72 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.408571  normal  0.630296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  22.17 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0228  hypothetical protein  25.95 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  21.82 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0176  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0246  hypothetical protein  26.24 
 
 		 420 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2639  hypothetical protein  26.09 
 
 		 417 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2580  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 403 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2305  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 403 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146682  hitchhiker  0.00602825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03047  elongator protein 3/MiaB/NifB  24.16 
 
 		 414 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1926  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000517647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0194  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 418 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  25 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1759  radical SAM family protein  25.42 
 
 		 411 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  22.93 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4146  radical SAM domain-containing protein  25.11 
 
 		 403 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3584  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 413 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  23.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2262  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 403 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.275727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  26.86 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1192  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.26 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.052698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  20.63 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  21.68 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3329  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 431 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  26.98 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  27.45 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01933  Radical SAM  25.7 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0407  radical SAM family protein  23.17 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.06 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.6 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6622  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  24.62 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4056  Radical SAM domain protein  22.3 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0826  radical SAM family protein  24.18 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.243039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3382  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3540  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 403 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  22.27 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0818  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 539 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  26.7 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  26.7 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  20.3 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  26.26 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0124  radical SAM family protein  24.6 
 
 		 431 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0282893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.08 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  25.65 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  21.7 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  21.67 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>