More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1673 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  100 
 
 
1048 aa  2171    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  55.61 
 
 
886 aa  979    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  37.81 
 
 
1078 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  37.5 
 
 
1072 aa  586  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.36 
 
 
1112 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 
1048 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  36.68 
 
 
1013 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  36.53 
 
 
1019 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  36.06 
 
 
1047 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 
1050 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  37.96 
 
 
990 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  36 
 
 
1047 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  35.46 
 
 
1006 aa  559  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  43.7 
 
 
924 aa  552  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.31 
 
 
925 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.05 
 
 
1007 aa  548  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  44.07 
 
 
918 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  44.07 
 
 
918 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  44.22 
 
 
918 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  44.44 
 
 
918 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  44.07 
 
 
918 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  44.07 
 
 
918 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  35.14 
 
 
1007 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  44.29 
 
 
918 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.81 
 
 
933 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
1074 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  43.81 
 
 
918 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  43.4 
 
 
918 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  43.56 
 
 
918 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  43.4 
 
 
918 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  43.07 
 
 
980 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  37.33 
 
 
1040 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  39.97 
 
 
1033 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.92 
 
 
1028 aa  506  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  35.84 
 
 
1019 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.46 
 
 
1029 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  33.96 
 
 
1185 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  32.48 
 
 
1065 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  36.54 
 
 
1175 aa  467  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.73 
 
 
1067 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  41.76 
 
 
958 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  41.52 
 
 
988 aa  466  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.9 
 
 
1099 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  33.69 
 
 
1063 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  49.67 
 
 
1531 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.29 
 
 
1026 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  40.5 
 
 
901 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
895 aa  437  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  40.09 
 
 
892 aa  439  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 
898 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  40.67 
 
 
899 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  37.83 
 
 
1194 aa  430  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  38.39 
 
 
902 aa  429  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
1152 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  47.08 
 
 
621 aa  426  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  39.75 
 
 
917 aa  426  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  40.56 
 
 
949 aa  409  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  39.6 
 
 
903 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
931 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  41.84 
 
 
1362 aa  357  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  40.42 
 
 
1087 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
1112 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  40.16 
 
 
1386 aa  354  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  39.84 
 
 
617 aa  352  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  43.1 
 
 
1080 aa  351  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.83 
 
 
1102 aa  350  6e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  37.98 
 
 
1178 aa  350  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  40.5 
 
 
1055 aa  348  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 
982 aa  344  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  41.03 
 
 
1071 aa  344  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  41.7 
 
 
1068 aa  343  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  42.83 
 
 
1108 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  37.77 
 
 
1068 aa  342  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 
1129 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.04 
 
 
1069 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.34 
 
 
977 aa  340  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  40.47 
 
 
1125 aa  338  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.17 
 
 
1086 aa  337  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  35.95 
 
 
1021 aa  337  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 
1139 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  37.16 
 
 
964 aa  337  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.92 
 
 
1091 aa  337  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38.5 
 
 
1062 aa  337  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  40.46 
 
 
1077 aa  336  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  39 
 
 
1354 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 
1082 aa  335  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  40.79 
 
 
1031 aa  335  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 
1068 aa  335  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  41.63 
 
 
1088 aa  334  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  40.42 
 
 
1003 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  42.12 
 
 
918 aa  332  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.07 
 
 
1082 aa  331  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  35.51 
 
 
1130 aa  331  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.9 
 
 
914 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40.5 
 
 
1113 aa  330  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.5 
 
 
1113 aa  330  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41.19 
 
 
777 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  42.47 
 
 
1066 aa  328  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  41.27 
 
 
663 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 
1069 aa  327  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>