58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1562 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  501  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  68.78 
 
 
237 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  60.17 
 
 
241 aa  317  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  59.15 
 
 
236 aa  308  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  55.61 
 
 
224 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  49.36 
 
 
250 aa  249  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  46.12 
 
 
263 aa  236  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  26.89 
 
 
248 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.91 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  27.54 
 
 
251 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  28.99 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  26.16 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  28.39 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  27.35 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  28.02 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  27.47 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  34.35 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  27.78 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  30.77 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  32.17 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  29.66 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  25.99 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  25.9 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  26.07 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  32 
 
 
550 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  28.35 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  26.67 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  30.95 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  23.61 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.08 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  22.65 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  22.36 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  22.36 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  22.36 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  22.22 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  22.36 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  22.36 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  22.36 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  22.36 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  23.32 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  23.85 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  20.26 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  22.41 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  21.43 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  21.43 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  21.43 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  28.7 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  19.55 
 
 
227 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  26.39 
 
 
233 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  22.87 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1460  hypothetical protein  27.54 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1988  hypothetical protein  29.78 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  24 
 
 
359 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  23.24 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1280  hypothetical protein  26.86 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  21.15 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0591  hypothetical protein  43.18 
 
 
45 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.425982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>