42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0967 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  100 
 
 
720 aa  1439    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.52 
 
 
614 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  29.88 
 
 
698 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  28.29 
 
 
697 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  26.02 
 
 
595 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.17 
 
 
1931 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  27.39 
 
 
777 aa  69.3  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  35.29 
 
 
709 aa  67.4  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.49 
 
 
547 aa  64.7  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  24.9 
 
 
954 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  22.7 
 
 
433 aa  62.4  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
1121 aa  62  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  27.17 
 
 
461 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  24.46 
 
 
919 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  27.08 
 
 
724 aa  55.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  24.83 
 
 
564 aa  54.7  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  26.89 
 
 
471 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  27.8 
 
 
382 aa  54.7  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  25.64 
 
 
1001 aa  53.9  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  25.89 
 
 
375 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.18 
 
 
940 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  24.76 
 
 
1056 aa  52  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  23.8 
 
 
641 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.26 
 
 
831 aa  50.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.69 
 
 
230 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  27.85 
 
 
635 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.57 
 
 
810 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  23.19 
 
 
805 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  35.56 
 
 
810 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  46.94 
 
 
627 aa  48.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.2 
 
 
677 aa  47.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  29.19 
 
 
972 aa  47.4  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  25.7 
 
 
892 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.86 
 
 
255 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.89 
 
 
254 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  27.06 
 
 
1025 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  24.91 
 
 
638 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  26.82 
 
 
735 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.23 
 
 
547 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  43.55 
 
 
960 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  23.95 
 
 
647 aa  44.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  26.21 
 
 
1242 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>