More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0159 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0159  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  256  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0749254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0953  response regulator receiver domain-containing protein  50.89 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.83954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0886  response regulator receiver domain-containing protein  48.28 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384988  normal  0.153587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3223  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.186882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1038  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2126  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2827  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 136 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  46.85 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 424 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  40.38 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  38.93 
 
 		 224 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  38.94 
 
 		 457 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 221 aa  83.6  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 896 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  39.32 
 
 		 896 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 896 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  39.42 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  37.17 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 896 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  39.09 
 
 		 466 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  41.46 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1816 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 896 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 896 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 896 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  37.61 
 
 		 896 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1195 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  37.61 
 
 		 896 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 239 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 2107 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 239 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 229 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 227 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  37.17 
 
 		 457 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  37.17 
 
 		 457 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1839 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  40.32 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0667  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0467725  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  42.86 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  37.17 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1155 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2645  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.492308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0400  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1131 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 2099 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  37.61 
 
 		 896 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1361 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 		 377 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  42.86 
 
 		 458 aa  78.6  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1857 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 2099 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 310 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 		 365 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 395 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1159 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1896 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  35.77 
 
 		 356 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 		 377 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3549  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 		 348 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0481  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 		 348 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 225 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  36.97 
 
 		 228 aa  77  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.2 
 
 		 236 aa  77  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4048  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.916406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1179 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  37.29 
 
 		 1278 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0596  response regulator receiver domain protein  33.33 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1782 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1177 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>