69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1786 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  75.91 
 
 		 550 aa  750    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  71.76 
 
 		 531 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  87.69 
 
 		 529 aa  877    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  76.29 
 
 		 538 aa  752    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  76.29 
 
 		 538 aa  752    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 526 aa  1026    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  46.49 
 
 		 502 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  38.8 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  30.6 
 
 		 542 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  29.14 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  30.06 
 
 		 538 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  30.63 
 
 		 542 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.02 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.42 
 
 		 553 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2610  hypothetical protein  29.76 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000643636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.6 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.09 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  25.37 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  32.21 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  25.37 
 
 		 657 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  25.37 
 
 		 657 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  25.37 
 
 		 657 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  25.37 
 
 		 657 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  25.37 
 
 		 657 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  25.98 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.35 
 
 		 306 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1858  serine/threonine-protein kinase  25.23 
 
 		 274 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.73 
 
 		 306 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  24.63 
 
 		 657 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  27.15 
 
 		 314 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.73 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.19 
 
 		 307 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.72 
 
 		 298 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.72 
 
 		 298 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  23.62 
 
 		 667 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  29.49 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.21 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.96 
 
 		 307 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.17 
 
 		 351 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  32.16 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  25.13 
 
 		 292 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  24.86 
 
 		 664 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  26.87 
 
 		 642 aa  47.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  26.44 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  24.64 
 
 		 305 aa  47.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  27.1 
 
 		 303 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5696  calcium-binding protein  29.51 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  25.62 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  24.03 
 
 		 770 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.36 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  26.63 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.68 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  30.08 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.57 
 
 		 1217 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  29.33 
 
 		 332 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  24.04 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2246  hypothetical protein  28.97 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  26.36 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.38 
 
 		 318 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.38 
 
 		 318 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  23.76 
 
 		 1293 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3582  hypothetical protein  27.78 
 
 		 289 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  29.8 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2741  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.46 
 
 		 290 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  25.83 
 
 		 306 aa  43.9  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28830  hypothetical protein  31.48 
 
 		 310 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.99 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  25.39 
 
 		 328 aa  43.5  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>