12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3582 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3582  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42680  hypothetical protein  92.73 
 
 		 289 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28830  hypothetical protein  47.87 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2399  hypothetical protein  44.68 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2246  hypothetical protein  43.97 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  26.89 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3457  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  33.04 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0967146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 642 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  27.31 
 
 		 502 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.15 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 538 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.39 
 
 		 526 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>