15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_28830  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2246  hypothetical protein  54.55 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2399  hypothetical protein  53.09 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3582  hypothetical protein  47.87 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42680  hypothetical protein  46.45 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  29.06 
 
 		 502 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  30.6 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.46 
 
 		 531 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.69 
 
 		 550 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  25.69 
 
 		 538 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.69 
 
 		 538 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  21.72 
 
 		 664 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  25 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.48 
 
 		 526 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  27.62 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>