72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1232 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 362 aa  695    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  97.24 
 
 		 362 aa  626  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  88.79 
 
 		 372 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  69.61 
 
 		 364 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  46.54 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  42 
 
 		 386 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 390 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.42 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  30.3 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 807 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.91 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 218 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  27.27 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.52 
 
 		 792 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 227 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  28.93 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  31.15 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 522 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  23.69 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 232 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 250 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 223 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 270 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  24.49 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0484  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.7 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 246 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7707  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 889 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1497  hypothetical protein  26.82 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 475 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  28.71 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0844  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 275 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 279 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0960  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 278 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>