87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4012 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  792    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  41.85 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  41.33 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  42.82 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  41.16 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  40.58 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  40.8 
 
 		 407 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  41.91 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  38.87 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  41.78 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  39.94 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  42.44 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  42.6 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  42.4 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  41.04 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  36.89 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  36.07 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  35.65 
 
 		 420 aa  162  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  32.75 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.65 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  32.36 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  32.36 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  37.57 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  35.67 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  34.2 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  32.56 
 
 		 394 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.43 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  29.57 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  28.42 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  33.44 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.93 
 
 		 676 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  29.66 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 643 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  25.14 
 
 		 627 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  31.15 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.89 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  22.95 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  23.45 
 
 		 612 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  23.45 
 
 		 612 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  28.11 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  30.51 
 
 		 602 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  22.38 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 604 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  23.37 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 604 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  24.54 
 
 		 625 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  21.85 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1619  extracellular ligand-binding receptor  41.79 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  29.82 
 
 		 604 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  22.33 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  21.97 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.63 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.24 
 
 		 376 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  29.82 
 
 		 604 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 		 461 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.79 
 
 		 467 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 		 461 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.26 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  22.67 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  21.79 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  21.94 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>