More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0664 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 281 aa  563  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  77.62 
 
 		 279 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  77.98 
 
 		 279 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  73.65 
 
 		 279 aa  417  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  74.73 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  72.56 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  72.2 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  71.84 
 
 		 279 aa  407  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  68.12 
 
 		 278 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  65.09 
 
 		 277 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  65.22 
 
 		 278 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  65.94 
 
 		 278 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  64.49 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  65.58 
 
 		 278 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  63.6 
 
 		 280 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  61.73 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  62.87 
 
 		 278 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  63.33 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  64.34 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 279 aa  345  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  61.73 
 
 		 278 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  63.84 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  63.87 
 
 		 272 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  66.42 
 
 		 282 aa  326  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  61.62 
 
 		 263 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 269 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  55.11 
 
 		 270 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  59.63 
 
 		 267 aa  322  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  58.46 
 
 		 269 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  58.46 
 
 		 269 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  55.51 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  58.09 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  66.8 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  56.62 
 
 		 268 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 269 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  56.2 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 268 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  65.56 
 
 		 263 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  65.56 
 
 		 263 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  56.78 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  59.6 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  53.15 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  53.75 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  53.31 
 
 		 266 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  50.54 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  47.43 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  45.9 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  47.72 
 
 		 270 aa  224  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  49.82 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  47.79 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 		 275 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  47.11 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  45.49 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  41.57 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  44.4 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  42.55 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  44.07 
 
 		 267 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  41.67 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  44.65 
 
 		 265 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  43.57 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  44.93 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  43.57 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  44.73 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  43.17 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  42.74 
 
 		 271 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  44.49 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  43.28 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  47.49 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  42.49 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  43.12 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  39.07 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>