More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0447 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  67.96 
 
 		 215 aa  251  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  60.8 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.44 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  52.02 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  52.41 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.7 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  51.34 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  48.29 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  45.19 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  45.64 
 
 		 202 aa  151  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50.8 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  43.56 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  43.37 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.55 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  50.53 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 338 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  43.98 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  44 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  45.31 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  45.08 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  40.2 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  49.23 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  43.84 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  46.97 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  46.07 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.15 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  48.11 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  47.74 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  46.27 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 283 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  41.29 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  48.09 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  46.97 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 198 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  41.5 
 
 		 255 aa  138  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  40 
 
 		 257 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  40.31 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  44.66 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  36.79 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  45.45 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  44.95 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  45.96 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  41.43 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  41.9 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  38.5 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  44.04 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  42.58 
 
 		 210 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  41.27 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  44.33 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  38.02 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>