More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2344 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 628 aa  1260    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 		 625 aa  585  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.12 
 
 		 629 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  37.48 
 
 		 605 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0821  putative PAS/PAC sensor protein  37.33 
 
 		 715 aa  236  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.99772  normal  0.688187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.21 
 
 		 608 aa  227  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.02 
 
 		 1329 aa  226  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.21 
 
 		 800 aa  223  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 781 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.63 
 
 		 903 aa  220  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.92 
 
 		 793 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 642 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.64 
 
 		 807 aa  204  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.97 
 
 		 659 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 535 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 593 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 		 531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 659 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 		 735 aa  193  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 543 aa  193  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  31.87 
 
 		 631 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 579 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 930 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 592 aa  160  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 477 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  26.5 
 
 		 628 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 974 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 640 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1497  diguanylate cyclase  26.33 
 
 		 510 aa  107  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000624142  hitchhiker  0.000000668265 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  33.63 
 
 		 588 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 520 aa  98.2  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 583 aa  98.2  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 646 aa  97.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.61 
 
 		 906 aa  97.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 633 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  33.33 
 
 		 906 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 604 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 723 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  26.2 
 
 		 528 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  28.09 
 
 		 523 aa  95.1  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 641 aa  94.4  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 437 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.29 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 678 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3633  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 517 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  35.16 
 
 		 908 aa  91.3  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 614 aa  91.3  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 590 aa  90.9  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  25 
 
 		 560 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  39.01 
 
 		 908 aa  90.1  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  34.66 
 
 		 908 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05220  diguanylate cyclase  30.1 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1021 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 524 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  28.31 
 
 		 387 aa  89  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 386 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 425 aa  88.6  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.34 
 
 		 613 aa  88.2  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 946 aa  88.2  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 711 aa  88.2  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 361 aa  88.6  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  25.08 
 
 		 465 aa  88.2  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  26.8 
 
 		 932 aa  87.4  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 431 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 969 aa  87.4  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 523 aa  87  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 606 aa  87  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.34 
 
 		 918 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  40.18 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.25 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  24.72 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 711 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.7 
 
 		 918 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 838 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 709 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.78 
 
 		 918 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.78 
 
 		 918 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.78 
 
 		 918 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.78 
 
 		 918 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.5 
 
 		 921 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.56 
 
 		 932 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  23.29 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.22 
 
 		 922 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.61 
 
 		 927 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>