More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2159 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  60.54 
 
 		 226 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  61.82 
 
 		 224 aa  281  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  58.72 
 
 		 224 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  54.91 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  46.82 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  45.61 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  44.34 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  45.41 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  41.3 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  44.74 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  37.27 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  39.46 
 
 		 227 aa  157  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  41.38 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  40.09 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  36.82 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  35 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  35 
 
 		 216 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  37.96 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  35.83 
 
 		 324 aa  108  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  35.32 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  34.87 
 
 		 332 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  34.45 
 
 		 330 aa  104  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  33.61 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  32.63 
 
 		 324 aa  97.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  32.48 
 
 		 358 aa  93.2  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  29.92 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  32.4 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  31.91 
 
 		 325 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  30.24 
 
 		 407 aa  82  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  31.38 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  30.38 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  29.41 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  34.78 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  30.09 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  31.8 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  32.07 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  32.39 
 
 		 358 aa  78.6  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  32.07 
 
 		 327 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  30.93 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  31.12 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  30.54 
 
 		 658 aa  76.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  31.58 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  31.58 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  32.53 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  31.58 
 
 		 322 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  30.09 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  28.39 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  30.17 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  31.2 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  35.27 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  32.95 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  33.53 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  32.95 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  31.9 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  34.91 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  32.37 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0201  recombinase A  32.75 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.911025  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  33.71 
 
 		 352 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  31.79 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  34.91 
 
 		 387 aa  68.6  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  30.52 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  30 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  34.22 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  29.68 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  34.22 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  28.77 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  33.14 
 
 		 352 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  32.75 
 
 		 364 aa  67  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  34.86 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  34.15 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  34.15 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  32.55 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  33.69 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  34.12 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  33.14 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  33.69 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  32.16 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3213  recombinase A  33.33 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.996939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1114  recombinase A  33.33 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  33.91 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  33.91 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  33.91 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  30.95 
 
 		 464 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  33.91 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1062  recombinase A  33.91 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  33.14 
 
 		 359 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  33.91 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  33.91 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  33.33 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  34.33 
 
 		 343 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1195  recombinase A  33.91 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>