More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3752 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3752  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
269 aa  517  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0797241  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3443  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  96.28 
 
 
269 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146237  normal  0.0184697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3641  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  91.01 
 
 
269 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0439997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5195  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.23 
 
 
269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5969  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  70.37 
 
 
272 aa  315  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68.18 
 
 
291 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.666902  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2208  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.6 
 
 
266 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3553  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.24 
 
 
268 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1178  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.61 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1590  RNA methyltransferase  51.14 
 
 
276 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00137189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.19 
 
 
275 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1579  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.38 
 
 
275 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0875411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3534  RNA methylase  47.96 
 
 
279 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.37 
 
 
274 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.144012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.37 
 
 
274 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0749589 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1533  RNA methyltransferase  48.67 
 
 
226 aa  188  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1015  RNA methyltransferase  38.7 
 
 
271 aa  185  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33920  rRNA methylase  40.98 
 
 
267 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10898  rRNA methyltransferase  40.15 
 
 
288 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4850  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 
270 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.0422374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4467  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 
270 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4554  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 
270 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0570  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.38 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.48 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1263  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4718  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.06 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1715  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.1 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41968  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.63 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.91 
 
 
266 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3008  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.63 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2671  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  38.83 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535925  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.76 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.98 
 
 
304 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.44269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.69 
 
 
269 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7648  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.35 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1614  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.04 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329704  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5673  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.67 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01360  rRNA methylase  37.23 
 
 
284 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.591406  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05470  rRNA methylase  36.99 
 
 
286 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2264  putative rRNA methylase  38.43 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0846  tRNA/rRNA methyltransferase  37.87 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.17 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1877  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.91 
 
 
269 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232601 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.24 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2046  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.23 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0496  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.2 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.69 
 
 
269 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04950  rRNA methylase  35.69 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21660  rRNA methylase  33.82 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.32 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111419  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13580  rRNA methylase  36.19 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1180  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
282 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.452059  decreased coverage  0.000681553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2308  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.14 
 
 
267 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15820  rRNA methylase  36.33 
 
 
275 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.582235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.02 
 
 
279 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0826  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.46 
 
 
269 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3360  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.23 
 
 
285 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0599  rRNA methylase  32.99 
 
 
292 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.441965  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11630  rRNA methylase  36.26 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0892  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.01 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0843  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.12 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.105002 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.37 
 
 
290 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.604815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4007  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.21 
 
 
275 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.169703  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49451  predicted protein  29.26 
 
 
389 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.21 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199948  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.17 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0303105  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.05 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4499  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  26.97 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.266243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.06 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.246575  normal  0.0568105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.96 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3539  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.45 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0474859  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  34.3 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.76 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0404  methyltransferase GidB  38.97 
 
 
490 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1800  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.03 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1483  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.24 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.67 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2978  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.46 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3022  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.46 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0296  SpoU rRNA methylase family protein  28.86 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172027 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.62 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.51 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1516  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.8 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3145  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.51 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00100034  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.3 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  30.59 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87970  predicted protein  34.04 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000586786  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.130362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.36 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1207  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.85 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0784669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30 
 
 
496 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306284  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  24.64 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21880  rRNA methylase  30.07 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01710  rRNA methylase  28.83 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.43805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5480  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.6 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666691  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.07 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.13 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  36.99 
 
 
386 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.53 
 
 
321 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>