More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0826 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0826  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
269 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33920  rRNA methylase  53.03 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0496  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.75 
 
 
283 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.76 
 
 
275 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4467  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.76 
 
 
270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4554  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.76 
 
 
270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4850  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.38 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.0422374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10898  rRNA methyltransferase  49.24 
 
 
288 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1715  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
268 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41968  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.81 
 
 
266 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4718  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.56 
 
 
268 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.88 
 
 
284 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.89 
 
 
307 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3008  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.41 
 
 
321 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.98 
 
 
267 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.7 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.66 
 
 
269 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.19 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.44269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5673  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.57 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.23 
 
 
276 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1263  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.24 
 
 
273 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1877  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.37 
 
 
269 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2264  putative rRNA methylase  44.36 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7648  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.84 
 
 
292 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0846  tRNA/rRNA methyltransferase  44.83 
 
 
316 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21660  rRNA methylase  39.05 
 
 
271 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05470  rRNA methylase  41.09 
 
 
286 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2671  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  41.26 
 
 
275 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535925  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01360  rRNA methylase  40.43 
 
 
284 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.591406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2208  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.18 
 
 
266 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0570  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.2 
 
 
272 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2308  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.08 
 
 
267 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1614  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.48 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329704  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2046  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.7 
 
 
279 aa  148  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1180  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.44 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.452059  decreased coverage  0.000681553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15820  rRNA methylase  36.96 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.582235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4007  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.55 
 
 
275 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.169703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3553  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.14 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13580  rRNA methylase  39.85 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.25 
 
 
279 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.65 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.28 
 
 
290 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.604815  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0599  rRNA methylase  32.76 
 
 
292 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.441965  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04950  rRNA methylase  36.58 
 
 
303 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1178  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.1 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0892  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.41 
 
 
316 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1579  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.45 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0875411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3360  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.05 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.41 
 
 
275 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1590  RNA methyltransferase  33.93 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00137189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5195  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.66 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3443  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.19 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146237  normal  0.0184697 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0843  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.61 
 
 
280 aa  119  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.105002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3752  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.19 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0797241  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11630  rRNA methylase  40.74 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.79 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.666902  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.31 
 
 
274 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.144012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5969  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.93 
 
 
272 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223084  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3534  RNA methylase  34.18 
 
 
279 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1533  RNA methyltransferase  34.67 
 
 
226 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.84 
 
 
274 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0749589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3641  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.07 
 
 
269 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0439997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1015  RNA methyltransferase  29.26 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49451  predicted protein  34.38 
 
 
389 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0915  rRNA methylase  25.38 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00701819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  27.42 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.14 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.14 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.44 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.71 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.246575  normal  0.0568105 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1899  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.21 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342149  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1268  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.61 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0417  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.82 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2978  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.71 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3022  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.71 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.09 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.94 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  22.74 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  36.31 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  23.48 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49741  predicted protein  31.38 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  26.57 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.75 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.130362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  30.38 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  30.38 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.48 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  26.57 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  25.86 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  26.2 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.66 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.87191  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  29.53 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  26.2 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  26.2 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  26.2 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.94 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  34.3 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.98 
 
 
542 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  26.2 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.99 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000179001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.16 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>