More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0211 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
283 aa  568  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05470  rRNA methylase  66.78 
 
 
286 aa  362  4e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01360  rRNA methylase  65.71 
 
 
284 aa  355  5e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.591406  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.06 
 
 
279 aa  329  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0599  rRNA methylase  57.64 
 
 
292 aa  318  5e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.441965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4007  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.8 
 
 
275 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.169703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04950  rRNA methylase  56.83 
 
 
303 aa  310  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21660  rRNA methylase  54.84 
 
 
271 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.82 
 
 
269 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2046  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.86 
 
 
279 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1877  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.18 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13580  rRNA methylase  55.17 
 
 
269 aa  252  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0843  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.86 
 
 
280 aa  250  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.105002 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.18 
 
 
276 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2308  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.94 
 
 
267 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.9 
 
 
290 aa  248  5e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.604815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15820  rRNA methylase  50.37 
 
 
275 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.582235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1180  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.48 
 
 
282 aa  236  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.452059  decreased coverage  0.000681553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.69 
 
 
269 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1614  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.57 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329704  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11630  rRNA methylase  47.18 
 
 
280 aa  219  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0570  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.93 
 
 
272 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.16 
 
 
267 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1263  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.66 
 
 
273 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143361  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.84 
 
 
307 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3008  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.49 
 
 
321 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.63 
 
 
304 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.44269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2671  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  42.37 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535925  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2264  putative rRNA methylase  44.73 
 
 
268 aa  198  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7648  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.55 
 
 
292 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5673  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.23 
 
 
332 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0846  tRNA/rRNA methyltransferase  44.11 
 
 
316 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10898  rRNA methyltransferase  40.99 
 
 
288 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33920  rRNA methylase  38.52 
 
 
267 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4467  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.46 
 
 
270 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4554  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.46 
 
 
270 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1715  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.07 
 
 
268 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4850  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.06 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.0422374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.41 
 
 
275 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.97 
 
 
266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0496  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.39 
 
 
283 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.3 
 
 
284 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4718  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.59 
 
 
268 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3553  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.94 
 
 
268 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3534  RNA methylase  35.23 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.14 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.144012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1590  RNA methyltransferase  34.74 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00137189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1178  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.88 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5969  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.71 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2208  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.51 
 
 
266 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5195  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.33 
 
 
269 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.01 
 
 
274 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0749589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1579  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.99 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0875411  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1533  RNA methyltransferase  38.16 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3443  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.11 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146237  normal  0.0184697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3752  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.24 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0797241  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0826  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.65 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1015  RNA methyltransferase  30.45 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.62 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.05 
 
 
291 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.666902  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3360  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.81 
 
 
285 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3641  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.68 
 
 
269 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0439997 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49451  predicted protein  30.95 
 
 
389 aa  89  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  23.84 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  23.76 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  23.84 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  23.84 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  23.84 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  23.84 
 
 
254 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  23.84 
 
 
254 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  23.49 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  23.4 
 
 
265 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  23.84 
 
 
254 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  23.4 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  23.75 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0766  hypothetical protein  29.01 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0296  SpoU rRNA methylase family protein  29.52 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172027 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  30.68 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0146  RNA methylase  25.91 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0892  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.27 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  23.67 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0769  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.59 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.81 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13158  SpoU rRNA methylase family protein  29.56 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0462  RNA methyltransferase  22.34 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.29 
 
 
496 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306284  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  33.89 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2978  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.8 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3022  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.8 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.24 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.28 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.914691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  23.86 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.66 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.246575  normal  0.0568105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.92 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199948  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2415  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.32 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  22.42 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.240976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.04 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.62 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.66 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  29.52 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>