More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4467 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4467  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
270 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4554  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
270 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4850  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  98.52 
 
 
270 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.0422374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  83.64 
 
 
275 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1715  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  82.33 
 
 
268 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41968  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10898  rRNA methyltransferase  77.53 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  70.61 
 
 
284 aa  349  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33920  rRNA methylase  59.33 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4718  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.11 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.26 
 
 
266 aa  282  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0496  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60 
 
 
283 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.45 
 
 
304 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.44269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1263  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.18 
 
 
273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143361  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.85 
 
 
307 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.9 
 
 
267 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0570  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.76 
 
 
272 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3008  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.56 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5673  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.64 
 
 
332 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2264  putative rRNA methylase  46.84 
 
 
268 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.35 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2671  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  45.49 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535925  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0846  tRNA/rRNA methyltransferase  44.17 
 
 
316 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1877  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.6 
 
 
269 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21660  rRNA methylase  41.04 
 
 
271 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01360  rRNA methylase  42.45 
 
 
284 aa  192  6e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.591406  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.19 
 
 
269 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0826  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.8 
 
 
269 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2308  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.44 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.86 
 
 
276 aa  185  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1614  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.96 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329704  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13580  rRNA methylase  44.75 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05470  rRNA methylase  40.78 
 
 
286 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7648  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.43 
 
 
292 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15820  rRNA methylase  37.74 
 
 
275 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.582235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4007  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.77 
 
 
275 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.169703  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.46 
 
 
283 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3553  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.43 
 
 
268 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2208  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.11 
 
 
266 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0599  rRNA methylase  36.01 
 
 
292 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.441965  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1178  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 
268 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2046  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.96 
 
 
279 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1180  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.23 
 
 
282 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.452059  decreased coverage  0.000681553 
 
 
-
 
NC_004310  BR1590  RNA methyltransferase  38.81 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00137189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3443  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.03 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146237  normal  0.0184697 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.64 
 
 
279 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1579  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.81 
 
 
275 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0875411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.9 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.144012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3534  RNA methylase  36.56 
 
 
279 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11630  rRNA methylase  39.03 
 
 
280 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3752  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 
269 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0797241  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.27 
 
 
274 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0749589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3641  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.66 
 
 
269 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0439997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1533  RNA methyltransferase  39.73 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5195  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.63 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37 
 
 
275 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.86 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.604815  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0892  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.86 
 
 
316 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0843  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.09 
 
 
280 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.105002 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04950  rRNA methylase  36.4 
 
 
303 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5969  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.37 
 
 
272 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223084  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1015  RNA methyltransferase  32.21 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.92 
 
 
291 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.666902  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3360  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.12 
 
 
285 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49451  predicted protein  33.85 
 
 
389 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.07 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  26.3 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  26.3 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.57 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  25.93 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  25.93 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  23.02 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  25.56 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  25.56 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  25.56 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  25.56 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.18 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  25.56 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.56 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.15 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.17 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.13 
 
 
245 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.88 
 
 
260 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01710  rRNA methylase  32.26 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.43805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  29.72 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  32.09 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  36.81 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.25 
 
 
496 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306284  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.92 
 
 
266 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  33.33 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  32.69 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  32.69 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  31.98 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.98 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.8 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  31.33 
 
 
226 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  32.89 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.92 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.14 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  31.02 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>