More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0165 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.130362  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0830  RNA methyltransferase  51.77 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0190975  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1148  RNA methyltransferase  50 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  50.22 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0289  RNA methyltransferase  48.46 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1418  conserved hypothetical protein, probable rRNA methyltransferase, TrmH family  49.34 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1908  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.09 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0149  RNA methyltransferase  46.26 
 
 		 227 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.913365  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0189  RNA methyltransferase  45.81 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0168  RNA methyltransferase  45.37 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0111  RNA methyltransferase  31.22 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  34.78 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  32.47 
 
 		 249 aa  111  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.16 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.6 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  43.62 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  34.06 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.14 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  30.22 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.1 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  34.48 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.23 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000179001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.1 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  39.51 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl088  rRNA methylase  28.09 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  35.63 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.2 
 
 		 250 aa  104  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  38.51 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0379  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.62 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  34.95 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  37.89 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  37.89 
 
 		 286 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  33.19 
 
 		 312 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.6 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  27.71 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  36.67 
 
 		 323 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  35.06 
 
 		 252 aa  101  8e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  27.95 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.6 
 
 		 310 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.71 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.77 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf131  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  32 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  32.07 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.36 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.27 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  31.22 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  30.26 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  30.09 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.26 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  35.94 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  37.82 
 
 		 291 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  30.13 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  30.13 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.49 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1899  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.65 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  33.51 
 
 		 288 aa  98.2  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.13 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1164  hypothetical protein  35.29 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  38.07 
 
 		 372 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0086  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.88 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.13 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.43 
 
 		 327 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  28.76 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.26 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 289 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.38 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.34 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.76 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.15 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.4 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  32.72 
 
 		 244 aa  95.5  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2919  RNA methyltransferase  31.9 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.211235 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  35.84 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.63 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.13 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.26 
 
 		 250 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1180  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.16 
 
 		 338 aa  94.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000228447  hitchhiker  0.0000274792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  37.14 
 
 		 373 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 288 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  37.63 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  28.38 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  28.5 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  33.33 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  28.38 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  31.86 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  29.11 
 
 		 314 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.81 
 
 		 321 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.84 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>