More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1908 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1908  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 		 226 aa  463  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.09 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.130362  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0149  RNA methyltransferase  46.67 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.913365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0830  RNA methyltransferase  43.3 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0190975  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0189  RNA methyltransferase  46.22 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0168  RNA methyltransferase  45.78 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1418  conserved hypothetical protein, probable rRNA methyltransferase, TrmH family  43.11 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1148  RNA methyltransferase  42.41 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  43.11 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0289  RNA methyltransferase  39.73 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  30 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  33.65 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  33.33 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl088  rRNA methylase  32.77 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  31.14 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  32.88 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  32.88 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  31.13 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  31.75 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.43 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  32.88 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.62 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  33.03 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.67 
 
 		 275 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.77 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  41.73 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.03 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  32.33 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.96 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  34.21 
 
 		 288 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  28.02 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.8 
 
 		 283 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.09 
 
 		 247 aa  98.2  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  37.57 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.69 
 
 		 327 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  32.27 
 
 		 261 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  29.33 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.7 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  29.68 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  29.58 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.95 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.13 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  29.54 
 
 		 323 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.78 
 
 		 246 aa  95.5  5e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.18 
 
 		 237 aa  95.5  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.46 
 
 		 273 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.41 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0111  RNA methyltransferase  27.07 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.46 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.6 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.49 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.6 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.99 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  29.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  29.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  29.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  29.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  29.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.71 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3029  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.3 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.068461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7648  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.1 
 
 		 292 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.26 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  36.05 
 
 		 288 aa  92  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  34.46 
 
 		 293 aa  91.7  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1890  RNA methyltransferase  36.76 
 
 		 253 aa  91.7  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.575059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.17 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.78 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.25 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  26.61 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0310  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.69 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.91 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.11 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  30.42 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.44 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  26.69 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  26.69 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  29.74 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  28.38 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.06 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  29.87 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.06 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.45 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  29.26 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  35.39 
 
 		 244 aa  89  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.85 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  33.51 
 
 		 312 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.57 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  29.87 
 
 		 247 aa  88.2  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.95 
 
 		 251 aa  88.2  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.94 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>