More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0189 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0189  RNA methyltransferase  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0168  RNA methyltransferase  99.12 
 
 		 227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0149  RNA methyltransferase  98.68 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.913365  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1418  conserved hypothetical protein, probable rRNA methyltransferase, TrmH family  66.81 
 
 		 226 aa  292  4e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0830  RNA methyltransferase  56.19 
 
 		 226 aa  265  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0190975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0289  RNA methyltransferase  56.83 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1148  RNA methyltransferase  55.31 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  53.54 
 
 		 226 aa  241  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.81 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.130362  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1908  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.22 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  32.62 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  34.88 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.78 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  32.48 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  29.1 
 
 		 323 aa  94.7  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.87 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  30.37 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  34.27 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  29.49 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  27.04 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  35.2 
 
 		 288 aa  92.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.76 
 
 		 310 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1180  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.02 
 
 		 338 aa  92.4  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000228447  hitchhiker  0.0000274792 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  32.56 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0111  RNA methyltransferase  29.06 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.78 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  32.23 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.16 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.13 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.32 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  24.89 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.21 
 
 		 292 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.21 
 
 		 292 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  26.92 
 
 		 245 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  33.51 
 
 		 312 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.87 
 
 		 327 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  34.55 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  30.05 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.5 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.39 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  34.55 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.93 
 
 		 256 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  28.39 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  28.82 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  27.27 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  27.92 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.07 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.43 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.7 
 
 		 246 aa  84.7  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  27.08 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl088  rRNA methylase  26.89 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf131  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  30.6 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.46 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.58 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.51 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.51 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.96 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.51 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  32.56 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  32.95 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  34.5 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  30 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  33.54 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.54 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.41 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.46 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.64 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  30.46 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  27.31 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.36 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  27.78 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  25.11 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  31.91 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002269  23S rRNA (guanosine-2'-O-) -methyltransferase RlmB  27.39 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  25.11 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.06 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.86 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0658  RNA methyltransferase  28.06 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  31.14 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  25.11 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  27.23 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.41 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.11 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0310  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.41 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  24.68 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.41 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.89 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  28.7 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  26.41 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  28.07 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0065  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.61 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000946676  normal  0.572135 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00084  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.39 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>