More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1516 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1516  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
262 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1675  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.85 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3229  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.79 
 
 
247 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004009  RNA methyltransferase TrmH family  38.65 
 
 
244 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1916  tRNA and rRNA methylase  37.65 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.581034  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1268  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.06 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01509  hypothetical protein  38.25 
 
 
244 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0330  RNA methyltransferase  37.45 
 
 
257 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.08 
 
 
243 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1465  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.46 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.1 
 
 
248 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145842  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_002950  PG0744  RNA methyltransferase  42.32 
 
 
254 aa  156  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1647  hypothetical protein  31.4 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2725  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.98 
 
 
253 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12258  putative tRNA/rRNA methyltransferase  33.46 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0464  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.55 
 
 
257 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.71 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2492  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.21 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.76 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.83 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1735  SpoU rRNA methylase family protein  34.23 
 
 
265 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2169  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.51 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000507695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  32.28 
 
 
265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.44 
 
 
268 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0955758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1207  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.77 
 
 
270 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0784669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  32.28 
 
 
254 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.05 
 
 
241 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.240976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  29.69 
 
 
267 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  32.28 
 
 
254 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  31.89 
 
 
265 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  29.03 
 
 
246 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1728  rRNA methylase  30.23 
 
 
257 aa  102  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  31.5 
 
 
254 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  31.5 
 
 
254 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  31.5 
 
 
254 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  31.89 
 
 
254 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  31.5 
 
 
265 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1394  rRNA methylase  29.67 
 
 
253 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  hitchhiker  1.76373e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.71 
 
 
254 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0294  rRNA methyltransferase  32.27 
 
 
245 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000126477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.5 
 
 
254 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0387  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.05 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.03 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.03 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0296  SpoU rRNA methylase family protein  30.65 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2125  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.03 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.72 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.72 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.68 
 
 
266 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  27.27 
 
 
274 aa  95.9  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0915  rRNA methylase  30.62 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00701819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.18 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0303105  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.42 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.83 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1221  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.29 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000766628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.02 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.08 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.411274  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  24.9 
 
 
257 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.71 
 
 
260 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  29.44 
 
 
234 aa  89.7  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0462  RNA methyltransferase  25.77 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.84 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4499  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  29.55 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.266243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3823  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.81 
 
 
261 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0827889  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02637  rRNA methyltransferase  27.78 
 
 
261 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.4 
 
 
294 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.16 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0417  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.54 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.34 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1800  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.45 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.13 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1606  RNA methyltransferase  29 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0012787  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0334  rRNA methylase  28.22 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.693845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3094  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.29 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922753  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4637  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.31 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0580801  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  24.26 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.16 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.08 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000452495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3008  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.71 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1697  putative RNA methylase  32.7 
 
 
275 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.64 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.61 
 
 
260 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479292  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1263  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.92 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.77 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  26.56 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0623  rRNA methylase  28.4 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2613  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.77 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.25 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1540  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00191583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2421  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2567  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3271  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1312  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000359271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.3 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199948  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2477  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2040  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000808188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  23.92 
 
 
262 aa  79  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1437  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.58 
 
 
235 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418693  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0025  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.4 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.13 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>