More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0087 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 332 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  92.77 
 
 		 332 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  92.47 
 
 		 332 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  82.12 
 
 		 332 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  81.02 
 
 		 332 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  82.35 
 
 		 354 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  77.81 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  53.74 
 
 		 350 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  51.99 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  52.86 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  50.52 
 
 		 311 aa  295  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  50.52 
 
 		 311 aa  295  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  48.64 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  45.91 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  48.24 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  45.94 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 		 339 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  43.99 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  44.57 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  32.25 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  48.28 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  32.78 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  28.47 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  32.32 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  32.11 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  32.11 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.63 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.96 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  27.9 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.62 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  31.3 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  31.3 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>