205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2275 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  61.73 
 
 
500 aa  645    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
489 aa  1004    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  62.5 
 
 
474 aa  630  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  58.69 
 
 
497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  55.76 
 
 
487 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  43.78 
 
 
498 aa  385  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  42.28 
 
 
488 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  39.26 
 
 
485 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  40.88 
 
 
483 aa  362  8e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  40.04 
 
 
487 aa  349  8e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  40 
 
 
484 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  39 
 
 
482 aa  322  8e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  38.15 
 
 
496 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  42.65 
 
 
374 aa  279  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  36.58 
 
 
513 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  35.29 
 
 
486 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  34.96 
 
 
486 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  44.79 
 
 
339 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  34.69 
 
 
486 aa  256  8e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  34.2 
 
 
487 aa  256  9e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  43.3 
 
 
547 aa  252  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  34.59 
 
 
516 aa  249  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  34.77 
 
 
478 aa  242  9e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  31.88 
 
 
511 aa  230  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  39.75 
 
 
334 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  38.94 
 
 
423 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  33.77 
 
 
389 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  34.89 
 
 
393 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  34.42 
 
 
396 aa  179  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  35.53 
 
 
391 aa  176  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  33.86 
 
 
399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  32.1 
 
 
351 aa  156  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 
420 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  33.11 
 
 
324 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  33.06 
 
 
420 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  29.07 
 
 
368 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  29.07 
 
 
374 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  29.07 
 
 
374 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  32.19 
 
 
408 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  27.27 
 
 
375 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  33.1 
 
 
429 aa  140  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  30.85 
 
 
349 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.94 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  31.12 
 
 
346 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  33.07 
 
 
355 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  31.65 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  33.33 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  34.19 
 
 
393 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  31.23 
 
 
341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.64 
 
 
346 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  30.1 
 
 
365 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  31.82 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  27.78 
 
 
360 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  31.68 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  30.74 
 
 
335 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  31.94 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  28.57 
 
 
347 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  28.57 
 
 
327 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  27.54 
 
 
672 aa  71.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  27.76 
 
 
658 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  27.83 
 
 
330 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  25.86 
 
 
658 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  25.41 
 
 
896 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  23.87 
 
 
672 aa  60.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0332  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.98 
 
 
313 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.0219127 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  25.57 
 
 
344 aa  58.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  28.57 
 
 
888 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  24.62 
 
 
655 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  24.62 
 
 
655 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  26.14 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  31.78 
 
 
217 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  27.33 
 
 
343 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16310  inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase  28.65 
 
 
311 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0050927  hitchhiker  0.00150657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  22.71 
 
 
333 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2854  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  26.14 
 
 
309 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2875  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  26.14 
 
 
309 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00391917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.1 
 
 
669 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  24.03 
 
 
657 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2456  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2635  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  24.03 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2585  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000705472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  24.03 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  24.03 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  24.03 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  25.96 
 
 
331 aa  54.3  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2837  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2832  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  24.03 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  24.7 
 
 
655 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  24.36 
 
 
657 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  29.53 
 
 
563 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  25 
 
 
657 aa  53.9  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  24.03 
 
 
657 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1919  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 
144 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  24.36 
 
 
657 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.5 
 
 
845 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  25.53 
 
 
675 aa  53.5  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  30.25 
 
 
215 aa  53.5  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>