More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3023 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
394 aa  815    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  54.59 
 
 
392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  52.31 
 
 
401 aa  410  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 
390 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  49.49 
 
 
399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  51.15 
 
 
393 aa  398  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  51.15 
 
 
400 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  47.31 
 
 
388 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  46.39 
 
 
398 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  46.51 
 
 
397 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  48.6 
 
 
399 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  46.08 
 
 
399 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  46.65 
 
 
398 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.06 
 
 
390 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  46.8 
 
 
390 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  46.8 
 
 
390 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  46.39 
 
 
398 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  46.25 
 
 
397 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  47.55 
 
 
396 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  46.25 
 
 
397 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  45.55 
 
 
397 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  45.9 
 
 
397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  46.68 
 
 
391 aa  362  8e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  46.77 
 
 
413 aa  361  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  46.92 
 
 
397 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  45.82 
 
 
392 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  45.66 
 
 
397 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  45.99 
 
 
397 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  47.8 
 
 
400 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  48.6 
 
 
386 aa  360  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  46.25 
 
 
397 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  45.29 
 
 
397 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  45.99 
 
 
397 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  45.32 
 
 
392 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  47.42 
 
 
377 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  46.41 
 
 
379 aa  358  9e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 
394 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  47.34 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 
378 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  44.36 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  44.96 
 
 
391 aa  353  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  44.7 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  44.96 
 
 
391 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  44.7 
 
 
392 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  44.16 
 
 
385 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  45.92 
 
 
390 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  45.98 
 
 
398 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  44.44 
 
 
392 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  46.13 
 
 
394 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  46.13 
 
 
377 aa  349  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  44.19 
 
 
392 aa  349  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  44.44 
 
 
392 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  44.19 
 
 
392 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  44.73 
 
 
401 aa  348  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  44.44 
 
 
391 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
377 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
377 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
377 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  44.44 
 
 
391 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  44.41 
 
 
390 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
377 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
377 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  44.1 
 
 
380 aa  346  4e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
377 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
377 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  44.22 
 
 
381 aa  345  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 
377 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  45.62 
 
 
377 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.22 
 
 
402 aa  345  1e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.59 
 
 
378 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  45.04 
 
 
418 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  45.99 
 
 
380 aa  343  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  45.83 
 
 
377 aa  342  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  43.73 
 
 
398 aa  342  7e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  44.44 
 
 
381 aa  342  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  44.56 
 
 
386 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  43.69 
 
 
393 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  44.47 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  45.29 
 
 
391 aa  339  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  45.6 
 
 
387 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  45.6 
 
 
377 aa  339  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  45.85 
 
 
387 aa  339  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  45.01 
 
 
394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.44 
 
 
390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  44.9 
 
 
393 aa  338  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  43.67 
 
 
380 aa  337  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  43.67 
 
 
380 aa  337  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  44.76 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  44.39 
 
 
383 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  43.54 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  44.3 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  45.04 
 
 
397 aa  336  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  44.82 
 
 
394 aa  334  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  46.02 
 
 
401 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  45.24 
 
 
381 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  42.16 
 
 
381 aa  333  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  43.5 
 
 
407 aa  332  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  44.59 
 
 
378 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 
378 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>