147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0840 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1100    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  69.49 
 
 		 540 aa  763    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  46.48 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.21 
 
 		 535 aa  475  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  47.3 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  45.88 
 
 		 530 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  27.51 
 
 		 570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  28.69 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  27.31 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  24.47 
 
 		 549 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  25.78 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  24.55 
 
 		 821 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  28.48 
 
 		 608 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  26.8 
 
 		 630 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  30.56 
 
 		 555 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  24.83 
 
 		 611 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  24.83 
 
 		 538 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  27.15 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  30.19 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  25.91 
 
 		 612 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  24.04 
 
 		 592 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  24.6 
 
 		 640 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  27.15 
 
 		 650 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  26.58 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  25.87 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  26.52 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  23.82 
 
 		 592 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  26.07 
 
 		 657 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  24.94 
 
 		 592 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  26.32 
 
 		 426 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  25.06 
 
 		 640 aa  100  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  25.06 
 
 		 640 aa  100  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  23.85 
 
 		 615 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  25.68 
 
 		 627 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  27.47 
 
 		 616 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  25.5 
 
 		 652 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  24.22 
 
 		 638 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  25.71 
 
 		 635 aa  96.7  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  25.5 
 
 		 622 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  25.23 
 
 		 647 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  26.21 
 
 		 512 aa  94.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  23.41 
 
 		 614 aa  94.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  24.64 
 
 		 644 aa  94  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  27.6 
 
 		 615 aa  94  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  26.93 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  24.6 
 
 		 558 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  26.97 
 
 		 647 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  24.88 
 
 		 529 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  25.49 
 
 		 610 aa  91.3  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  28.1 
 
 		 424 aa  90.9  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  26.68 
 
 		 673 aa  91.3  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  25.25 
 
 		 606 aa  89.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  26.65 
 
 		 673 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  24.77 
 
 		 694 aa  86.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  26.41 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  26.62 
 
 		 673 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  23.93 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  27.2 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  24.59 
 
 		 690 aa  82.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  24.11 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  24.12 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  26.04 
 
 		 683 aa  77.4  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  26.39 
 
 		 612 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  22.62 
 
 		 627 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  24.41 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.36 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  27.89 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  23.79 
 
 		 679 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  26.61 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  24.35 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  21.97 
 
 		 537 aa  67  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  21.2 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.03 
 
 		 639 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0175  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  41.54 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 		 370 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.7 
 
 		 762 aa  50.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  40.68 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.09 
 
 		 153 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.09 
 
 		 153 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1700  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1307  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17321  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.09 
 
 		 153 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1278  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4980  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_002936  DET1565  iron-sulfur cluster-binding protein  38.98 
 
 		 83 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000782639  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.09 
 
 		 153 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  35.59 
 
 		 81 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  35.59 
 
 		 81 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1184  photosystem I subunit VII  35.59 
 
 		 81 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00269057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20591  photosystem I subunit VII  35.59 
 
 		 81 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.594482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  35.59 
 
 		 99 aa  47  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0127  photosystem I subunit VII  35.59 
 
 		 91 aa  47  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.409793  hitchhiker  0.00279555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  39.66 
 
 		 1069 aa  47  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1154  ferredoxin  42.62 
 
 		 277 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.445743 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  39.66 
 
 		 1070 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>