More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0702 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
153 aa  321  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  88.24 
 
 
153 aa  295  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  86.27 
 
 
153 aa  292  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  86.93 
 
 
153 aa  292  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  86.27 
 
 
153 aa  291  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  44.19 
 
 
165 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 
169 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
163 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
162 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 
181 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
177 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
169 aa  100  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  38.69 
 
 
167 aa  100  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
165 aa  101  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
171 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  43.09 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
170 aa  99.4  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
165 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
162 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  41.79 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
139 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  40.48 
 
 
162 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
167 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
167 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
162 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
163 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  39.37 
 
 
162 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  97.1  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  38.76 
 
 
164 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  40.48 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  43.24 
 
 
184 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  40.48 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  40.48 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  40.48 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  37.98 
 
 
224 aa  95.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  40.48 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  40.32 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.53 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  40.32 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  40.83 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  40.83 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  41.23 
 
 
165 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  40.32 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  45.28 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  38.71 
 
 
163 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
163 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
161 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>