More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3408 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
139 aa  287  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  92.09 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  84.78 
 
 
139 aa  250  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  250  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  83.33 
 
 
139 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  84.06 
 
 
139 aa  249  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.86 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.09 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.07 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.94 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.76 
 
 
153 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.31 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.35 
 
 
216 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.83 
 
 
178 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.64 
 
 
216 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.41 
 
 
170 aa  89.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.33 
 
 
179 aa  88.6  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  36.96 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.93 
 
 
229 aa  88.6  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.29 
 
 
176 aa  87  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  37.8 
 
 
164 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  37.69 
 
 
218 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.3 
 
 
234 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.21 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  39.52 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  38.35 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  35.82 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  39.5 
 
 
200 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
163 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
163 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 
163 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  39.67 
 
 
182 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.51 
 
 
171 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  39.67 
 
 
182 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  39.67 
 
 
182 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
167 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  39.67 
 
 
182 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
167 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  34.62 
 
 
215 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.56 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240126  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  37.4 
 
 
171 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  38.21 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.36 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  36.15 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  35.21 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  32.62 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  38.66 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  36.15 
 
 
208 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.34 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  37.12 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  36.15 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  36.15 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.26 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  38.66 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  37.7 
 
 
177 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.71 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  38.84 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  37.6 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  35.38 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  36.5 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  34.4 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  38.84 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.19 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.51 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  35.38 
 
 
208 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  34.4 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.5 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  38.02 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  35.04 
 
 
177 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  34.53 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  36.64 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.37 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  35.61 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  35.61 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  35.61 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.28 
 
 
165 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.58 
 
 
234 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>