More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0320 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
234 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0669  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  76.96 
 
 
417 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  80.12 
 
 
178 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  68.75 
 
 
216 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  77.16 
 
 
531 aa  251  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000747261  hitchhiker  0.000000428975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  74.36 
 
 
216 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.72 
 
 
168 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240126  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6656  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.75 
 
 
173 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.86 
 
 
183 aa  111  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.06 
 
 
234 aa  99  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0982  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.41 
 
 
134 aa  95.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
182 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
182 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.13 
 
 
182 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
171 aa  92.8  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
178 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
171 aa  92  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
139 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  41.13 
 
 
182 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  41.13 
 
 
182 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  41.13 
 
 
182 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  41.13 
 
 
182 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.41 
 
 
180 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  38.97 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.39 
 
 
171 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
182 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  36.23 
 
 
139 aa  88.6  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
182 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.98 
 
 
284 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  38.62 
 
 
182 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  38.62 
 
 
182 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.97 
 
 
131 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 
135 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.09 
 
 
175 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
139 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
176 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
139 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  34.84 
 
 
185 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.55 
 
 
170 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.54 
 
 
165 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  37.3 
 
 
139 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
167 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
167 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  37.04 
 
 
132 aa  85.1  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.56 
 
 
132 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.56 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  37.31 
 
 
167 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.46 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.64 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  36.3 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  38.3 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.56 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  41.6 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.56 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  37.31 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  35.33 
 
 
163 aa  82  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.56 
 
 
135 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  38.06 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.92 
 
 
264 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.37 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  32.42 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  37.06 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.27 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  37.06 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  31.84 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  37.06 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  32.04 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  31.84 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  36.57 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  29.15 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.76 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  31.84 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  35.92 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  30.15 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>