More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0468 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  92.52 
 
 
216 aa  364  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  80.12 
 
 
168 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240126  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0669  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  75.31 
 
 
417 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  77.22 
 
 
178 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  76.28 
 
 
234 aa  254  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  79.86 
 
 
531 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000747261  hitchhiker  0.000000428975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6656  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.17 
 
 
173 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.4 
 
 
183 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  39.1 
 
 
171 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0982  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.38 
 
 
134 aa  95.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
284 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  37.12 
 
 
139 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.78 
 
 
234 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.41 
 
 
264 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.41 
 
 
267 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.41 
 
 
270 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  36.6 
 
 
167 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  39.01 
 
 
182 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  37.78 
 
 
178 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 
139 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  38.3 
 
 
182 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.04 
 
 
170 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  38.3 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  38.35 
 
 
182 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  38.35 
 
 
182 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  38.35 
 
 
182 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.59 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  38.35 
 
 
182 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.06 
 
 
170 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.62 
 
 
135 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.3 
 
 
131 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  32.02 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
171 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  37.09 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.07 
 
 
165 aa  85.1  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  37.04 
 
 
132 aa  84.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  38.81 
 
 
169 aa  84.3  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.81 
 
 
132 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  38.06 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.82 
 
 
175 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  31.15 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.63 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.21 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.8 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  31.84 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  32.43 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  31.33 
 
 
175 aa  82  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
182 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
182 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
176 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  31.87 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  32.5 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  31.31 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  31.72 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  32.48 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  32.6 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  29.78 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  36.17 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  31.87 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  29.15 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  32.48 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.21 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  29.38 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  32.42 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  36.11 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  29.38 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  39.55 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  32.28 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  36.3 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  38.06 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  35.06 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.34 
 
 
171 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>