More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6656 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6656  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
173 aa  343  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0669  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  62.24 
 
 
417 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.45 
 
 
216 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.66 
 
 
168 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240126  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.12 
 
 
234 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.69 
 
 
178 aa  174  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  58.78 
 
 
216 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.07 
 
 
531 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000747261  hitchhiker  0.000000428975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0982  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.93 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.85 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.58 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.35 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  35.96 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0636  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.41 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.41 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.41 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.05 
 
 
234 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
182 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
182 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
182 aa  61.6  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
182 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
182 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.77 
 
 
175 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
182 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  33.33 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.46 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  33.63 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  33.63 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  33.63 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  33.63 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  34.21 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.95 
 
 
135 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  34.09 
 
 
167 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  34.09 
 
 
167 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  31.06 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
170 aa  57.8  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
170 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  31.93 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
170 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
162 aa  57.8  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  30.6 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  32.77 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  31.71 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  30.08 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  34.21 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.82 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  35.16 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  39.13 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  32.14 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  29.01 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.68 
 
 
222 aa  55.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0748  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.87 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
449 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  38.04 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  37.66 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  30.3 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  34.48 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  29.82 
 
 
252 aa  55.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  31.25 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  32.46 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>