More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1210 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
160 aa  334  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.03 
 
 
165 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0982  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.01 
 
 
134 aa  118  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.6 
 
 
135 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.09 
 
 
229 aa  89.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_799  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain I)  33.53 
 
 
183 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.9 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.04 
 
 
183 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  39.05 
 
 
176 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  37.78 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  39.13 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  39.13 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  39.32 
 
 
180 aa  87.4  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  35.59 
 
 
182 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.17 
 
 
169 aa  87.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0812  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.98 
 
 
183 aa  87.4  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
163 aa  87.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  36.3 
 
 
165 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0748  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.07 
 
 
183 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  32.48 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  40.18 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.54 
 
 
197 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  36.88 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  36.88 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  36.88 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.17 
 
 
300 aa  84.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
182 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 
182 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
162 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  84  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
162 aa  84  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.04 
 
 
152 aa  84  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
162 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.39 
 
 
132 aa  84  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
182 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
162 aa  84  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
182 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
182 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
162 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
163 aa  84  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
182 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  37.39 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.83 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  35.04 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  40.78 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  34.68 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  34.81 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  34.07 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  36.3 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  36.3 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  40.78 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.69 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.9 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  32.86 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.39 
 
 
254 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.97 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  34.88 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  35.88 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  35.88 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  35.88 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.57 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.53 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 
273 aa  80.9  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.85 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.52 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
208 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.61 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.61 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
184 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.53 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  32.53 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>