More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_799 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_799  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain I)  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0812  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  92.35 
 
 
183 aa  353  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, I subunit  95.86 
 
 
169 aa  343  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  42.74 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  42.15 
 
 
208 aa  94.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  42.15 
 
 
208 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  42.15 
 
 
208 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  41.88 
 
 
218 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  44.64 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  33.73 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  34.73 
 
 
193 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  42.02 
 
 
208 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  42.24 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.14 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.03 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.26 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  41.44 
 
 
218 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  41.44 
 
 
218 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  40.83 
 
 
176 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  34.15 
 
 
165 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  38.53 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  40.4 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  44.74 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  40.18 
 
 
215 aa  85.5  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  45.61 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.98 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
163 aa  85.5  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  39.32 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  39.32 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  38.79 
 
 
210 aa  85.5  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  38.83 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.84 
 
 
132 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.28 
 
 
149 aa  85.5  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  38.84 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.09 
 
 
234 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  39.47 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.88 
 
 
135 aa  84.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  38.6 
 
 
167 aa  84.3  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  38.6 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  36.64 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0982  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.6 
 
 
134 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  34.93 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  41.75 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  38.94 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  39.84 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  36.13 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.82 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  35.09 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.21 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  41.75 
 
 
163 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.51 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  37.9 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.51 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  38.6 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  38.05 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  37.72 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.87 
 
 
234 aa  80.9  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  37.72 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  38.79 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  36.94 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  38.83 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  38.79 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  35.65 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  37.86 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  32.93 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  32.88 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.66 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.51 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  38.83 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  37.19 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  36.04 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  39.09 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  32.32 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  32.32 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  38.83 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  38.83 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  37.86 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  38.83 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>