More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3296 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
139 aa  286  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  92.09 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  259  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  259  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  259  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  259  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  259  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  259  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  259  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  259  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  89.13 
 
 
139 aa  258  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  88.41 
 
 
139 aa  258  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  88.41 
 
 
139 aa  257  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 
165 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.79 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.53 
 
 
178 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.37 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.31 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.1 
 
 
216 aa  94.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.31 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.41 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.39 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 
234 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
216 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38 
 
 
179 aa  90.1  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.96 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.04 
 
 
168 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240126  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.76 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.57 
 
 
229 aa  88.6  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.6 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.85 
 
 
234 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  37.68 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  39.34 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.69 
 
 
203 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.15 
 
 
177 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  38.21 
 
 
194 aa  84.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  39.5 
 
 
200 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
182 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
182 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
182 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
182 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.96 
 
 
199 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  39.52 
 
 
169 aa  84  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.8 
 
 
300 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  36.5 
 
 
177 aa  83.6  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  34.51 
 
 
163 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.66 
 
 
531 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000747261  hitchhiker  0.000000428975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  38.35 
 
 
171 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  36.92 
 
 
174 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  36.92 
 
 
174 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 
182 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  38.66 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  38.66 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  37.82 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  38.66 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  37.6 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  36.92 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.84 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.06 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.88 
 
 
183 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0669  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  37.29 
 
 
417 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  36.97 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  37.82 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  35.04 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.16 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  37.12 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_799  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain I)  38.6 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  37.7 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.36 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  34.4 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  38.76 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  37.12 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  36.13 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
202 aa  80.5  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  36.8 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  37.21 
 
 
182 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  37.19 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.5 
 
 
168 aa  80.1  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  36.8 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  34.62 
 
 
252 aa  80.1  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
211 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
193 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  36.15 
 
 
208 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
180 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.15 
 
 
247 aa  80.1  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>