120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3484 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  100 
 
 
81 aa  167  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  97.53 
 
 
81 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  97.53 
 
 
81 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4980  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 
81 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1307  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 
81 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1278  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 
81 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0535  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 
81 aa  161  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.966086  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0454  photosystem I subunit VII  92.59 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11246  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17321  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 
81 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 
99 aa  160  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1700  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 
81 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1184  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 
81 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00269057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20591  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 
81 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.594482  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0127  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 
91 aa  160  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.409793  hitchhiker  0.00279555 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18171  photosystem I subunit VII  92.59 
 
 
81 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.102176  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17951  photosystem I subunit VII  92.59 
 
 
81 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.028019  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18001  photosystem I subunit VII  92.59 
 
 
81 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  90.12 
 
 
81 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.82 
 
 
840 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 
369 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.71 
 
 
327 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  37.29 
 
 
540 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  36.76 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.36 
 
 
316 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.33 
 
 
509 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  44.64 
 
 
507 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.64 
 
 
438 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.371983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.55 
 
 
404 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  37.7 
 
 
500 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.9 
 
 
540 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.44 
 
 
275 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.85 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.71 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
509 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.33 
 
 
634 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  40.68 
 
 
278 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 
431 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  35.59 
 
 
213 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.59 
 
 
213 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.33 
 
 
310 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.43 
 
 
331 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  37.7 
 
 
500 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  36.51 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.66 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  37.7 
 
 
500 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
393 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30 
 
 
271 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.29 
 
 
507 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.62 
 
 
184 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.07 
 
 
500 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0708  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 
393 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2143  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  35.06 
 
 
1180 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.955322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.85 
 
 
266 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 
421 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  41.07 
 
 
502 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.34 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  35.59 
 
 
509 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  35 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.82 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  37.74 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.62 
 
 
432 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 
394 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
331 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.39 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  32.31 
 
 
870 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.483259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.15 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121057  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.6 
 
 
378 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
331 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1813  ferredoxin, 4Fe-4S  39.29 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  41.67 
 
 
277 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
740 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0265662  normal  0.894509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2474  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.35 
 
 
269 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  36.21 
 
 
501 aa  41.2  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2321  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157203  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.67 
 
 
368 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  36.84 
 
 
188 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  37.74 
 
 
188 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.21 
 
 
423 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.16 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.8 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1210  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 
393 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 
569 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.43 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>