114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5001 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
98 aa  202  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4334  4Fe-4S ferredoxin  64.44 
 
 
111 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.833828  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  61.7 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60.64 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.7 
 
 
113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4871  putative ferrodoxin  60.44 
 
 
106 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.9 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247179  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.04 
 
 
107 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.25 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2580  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  50 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2625  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0538354  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2619  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.55 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  48.89 
 
 
125 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  50 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.69 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.06 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
840 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5623  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147371  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1662  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0485  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.251159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0570  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1636  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.39 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170259  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0164643  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2944  iron-sulfur cluster-binding protein  46.67 
 
 
155 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1441  ferredoxin family protein  32.5 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722291  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.33 
 
 
500 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  32.18 
 
 
500 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  32.18 
 
 
500 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0909  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  35.14 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.495197  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  30.23 
 
 
272 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  30.85 
 
 
96 aa  43.9  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  35.38 
 
 
188 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  35.94 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  30.51 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  37.66 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  37.66 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0703  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
271 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  34.88 
 
 
163 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1428  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.92 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1139  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  36.67 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1295  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  40 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000492894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  34.62 
 
 
385 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  37.66 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  37.66 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  37.66 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  37.66 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.33 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 
369 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  34.88 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2334  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.56 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.948614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.81 
 
 
335 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  33.82 
 
 
279 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.79 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1880  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  40 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0245187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.38 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1114  ferredoxin protein  34.44 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00024148  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  41.82 
 
 
81 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.38 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 
699 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  35.94 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  37.33 
 
 
162 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  32.56 
 
 
163 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  41.82 
 
 
81 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.48 
 
 
687 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  41.82 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.88 
 
 
404 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  35.85 
 
 
421 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  33.72 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  33.72 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  33.33 
 
 
318 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.3 
 
 
409 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0242  Coenzyme F420 hydrogenase  32.65 
 
 
538 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1053  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000113121  normal  0.154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  35.53 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  35.53 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  30.23 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.65 
 
 
356 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  34.55 
 
 
383 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1184  photosystem I subunit VII  41.82 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00269057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  35.53 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.96 
 
 
368 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20591  photosystem I subunit VII  41.82 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.594482  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  36 
 
 
226 aa  40.4  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  31.03 
 
 
167 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  34.48 
 
 
163 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.51 
 
 
327 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.96 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  40 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0762  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.55 
 
 
628 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.58 
 
 
552 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0817  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  36.67 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>