217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0589 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  781    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  35.01 
 
 
378 aa  235  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  35.64 
 
 
398 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  39.65 
 
 
375 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  39.72 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  39.88 
 
 
383 aa  216  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  38.24 
 
 
384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  35.64 
 
 
377 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  38.26 
 
 
398 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  38.76 
 
 
375 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  36.84 
 
 
379 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  35.53 
 
 
379 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  34.29 
 
 
377 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  32.3 
 
 
375 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  36 
 
 
392 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  34.97 
 
 
382 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  35.23 
 
 
376 aa  192  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  34.82 
 
 
382 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  38.1 
 
 
451 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  34.93 
 
 
382 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  38.62 
 
 
378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  32.8 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  38.33 
 
 
378 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  37.29 
 
 
376 aa  186  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  33.16 
 
 
396 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  30.38 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  30.7 
 
 
382 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  37.25 
 
 
261 aa  143  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  37.25 
 
 
261 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  31.83 
 
 
323 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  32.94 
 
 
318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  32.82 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  29.28 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  36.73 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  32.43 
 
 
319 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  34.36 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  34.17 
 
 
293 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  33.75 
 
 
293 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  31.58 
 
 
303 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  33.33 
 
 
316 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  33.22 
 
 
328 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  35.1 
 
 
332 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  34.4 
 
 
330 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  30.77 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  34.71 
 
 
306 aa  96.7  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  31.67 
 
 
309 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  31.95 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  33.88 
 
 
294 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  30.52 
 
 
282 aa  90.9  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  34.02 
 
 
293 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  32.21 
 
 
348 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  27.62 
 
 
331 aa  86.3  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  31.42 
 
 
318 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  29.25 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  27.52 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  26.76 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  27.78 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.82 
 
 
618 aa  76.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  27.04 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  26.14 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  35.07 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  26.56 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  24.39 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  29.51 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  30.83 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  31.33 
 
 
442 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  28.81 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  28.81 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  27.05 
 
 
332 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  27.54 
 
 
305 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  27.5 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  25.76 
 
 
260 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  24.57 
 
 
301 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  22.53 
 
 
307 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  28.9 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.51 
 
 
65 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  40.43 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0429  hypothetical protein  27.14 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  25.86 
 
 
261 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  29.28 
 
 
306 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.78 
 
 
75 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.3 
 
 
439 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1361  Iron-sulfur cluster-binding protein  40.35 
 
 
64 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385025  hitchhiker  0.00000000000102119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.3 
 
 
442 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1467  iron-sulfur cluster-binding protein  38.6 
 
 
64 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0638902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  24.54 
 
 
358 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.21 
 
 
672 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.93 
 
 
64 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 
64 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  39.58 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1667  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 
70 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  34.92 
 
 
266 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  41.27 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  36.99 
 
 
436 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0790  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  42.86 
 
 
700 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.04 
 
 
67 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0009  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.74 
 
 
97 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.58 
 
 
65 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1326  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.21 
 
 
64 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000117885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>