79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3481 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.32 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2625  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.63 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0538354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2580  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  57.63 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2619  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.63 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.25 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.14 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.99 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.21 
 
 		 113 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4334  4Fe-4S ferredoxin  51.65 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.833828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4871  putative ferrodoxin  55.56 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  45.56 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  48.86 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.57 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.09 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 		 840 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0630623  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.612108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4424  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 563 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  30.26 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 		 762 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  38.18 
 
 		 500 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  38.18 
 
 		 500 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  33.33 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.69 
 
 		 710 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  33.33 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.71 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  32.91 
 
 		 507 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0264  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.208407  normal  0.175405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  33.9 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  32.91 
 
 		 507 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  38.98 
 
 		 189 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  33.9 
 
 		 197 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1238  pyruvate synthase, gamma subunit  36.07 
 
 		 310 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.18 
 
 		 500 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0036  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  31.25 
 
 		 750 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00274533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.99 
 
 		 92 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  40.68 
 
 		 272 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 112 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16940  4Fe-4S protein  37.88 
 
 		 450 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  30.14 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1492  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.55 
 
 		 247 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.91 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44 
 
 		 404 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 559 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.5 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0241  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.88 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4212  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.88 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  30.14 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0354  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.44 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.386298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0697  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 404 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  35.06 
 
 		 278 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.86 
 
 		 368 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.78 
 
 		 404 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0314  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 404 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 404 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 415 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  38.98 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  40.68 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 415 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  33.93 
 
 		 580 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.03 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 418 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 415 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1583  heterodisulfide reductase, subunit A/hydrogenase, delta subunit, putative  31.11 
 
 		 750 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2424  ferredoxin II  35.71 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.003887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  30.36 
 
 		 558 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 68 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1201  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.89 
 
 		 362 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.337765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>