83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0310 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
321 aa  641    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0352  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.79 
 
 
392 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0028801  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.16 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1493  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.41 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.93 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.360841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.22 
 
 
368 aa  65.9  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.5 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.09 
 
 
374 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.84 
 
 
321 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.187801  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.8 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.09 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.38 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.58 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2897  putative polyferredoxin  22.12 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2679  putative polyferredoxin  22.47 
 
 
287 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2766  putative polyferredoxin  22.47 
 
 
287 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2785  putative polyferredoxin  22.12 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.89 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000264067  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.02 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.204655  normal  0.267306 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.73 
 
 
455 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2722  putative polyferredoxin  22.12 
 
 
287 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3744  putative polyferredoxin  21.74 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  19.67 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.581713  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.47 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0754  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.84 
 
 
557 aa  53.5  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1379  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.4 
 
 
557 aa  52.8  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  21.16 
 
 
552 aa  52.8  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1545  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  24.92 
 
 
553 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13340  4Fe-4S protein  20.71 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1450  putative ferredoxin  20.89 
 
 
558 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2353  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  30.48 
 
 
712 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.79 
 
 
547 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.4 
 
 
461 aa  50.8  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.906646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0275  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.08 
 
 
557 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.380935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1285  iron-sulfur cluster-binding domain protein, putative ferridoxin  25 
 
 
550 aa  49.7  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1568  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.08 
 
 
557 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.62 
 
 
194 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.11 
 
 
680 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.09 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.99 
 
 
553 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.19 
 
 
553 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  19.28 
 
 
371 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.09 
 
 
553 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0130862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.17 
 
 
481 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 
670 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3118  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.48 
 
 
674 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.99 
 
 
553 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.504849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.99 
 
 
553 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 
670 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1113  NIL domain protein  34.85 
 
 
147 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.646686  normal  0.0231239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  33.33 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  33.33 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  22.26 
 
 
558 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.68 
 
 
147 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.712445  normal  0.0546768 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0476  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 
160 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02274  ferredoxin  34.12 
 
 
553 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.36 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1714  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.16 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.56 
 
 
398 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.6 
 
 
675 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.63 
 
 
553 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.94 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.531455  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.3 
 
 
672 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.32 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000152495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  29.82 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.63 
 
 
553 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413842  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0175  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.33 
 
 
455 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.29 
 
 
481 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.19 
 
 
553 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.78 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00229195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
84 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0096  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.84 
 
 
383 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.337966  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0396  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  20.24 
 
 
652 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.599531  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1428  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.39 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0805152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.92 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003497  iron-sulfur cluster-binding protein  28.39 
 
 
553 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0994  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.07 
 
 
395 aa  43.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2764  4Fe-4S ferredoxin  23.44 
 
 
726 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  30.56 
 
 
261 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  30.56 
 
 
261 aa  42.7  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2148  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.37 
 
 
508 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.43 
 
 
370 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2236  pyruvate synthase delta chain  39.13 
 
 
85 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>