74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0473 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.5 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.360841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2610  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.53 
 
 		 377 aa  92.4  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1493  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.33 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.51 
 
 		 371 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0495  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.18 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.25 
 
 		 363 aa  86.3  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.94 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.517717  normal  0.0153359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0352  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.96 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0028801  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.07 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.96 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06190  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  26.28 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.348561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.84 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0837451  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.95 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.79 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.531455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.59 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000264067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  22.99 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.23 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.204655  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.187801  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0622  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.35 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.421879  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22710  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  24.36 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.941505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.58 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.6 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.12 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.45 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0396  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.03 
 
 		 652 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.599531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.23 
 
 		 695 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.7 
 
 		 687 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.56 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.55 
 
 		 699 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.7 
 
 		 552 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.57 
 
 		 383 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.581713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16960  4Fe-4S protein  22.81 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.49 
 
 		 547 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06210  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  24.08 
 
 		 425 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.68 
 
 		 696 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.28 
 
 		 455 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1545  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.83 
 
 		 553 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0262  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0832222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1450  putative ferredoxin  25.08 
 
 		 558 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0341  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  45.16 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16940  4Fe-4S protein  20.91 
 
 		 450 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1572  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 205 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.32 
 
 		 383 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000152495  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 		 1016 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0539  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.56 
 
 		 568 aa  45.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.289603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0471  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  31.51 
 
 		 105 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  23.81 
 
 		 580 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 		 1126 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2146  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.471732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.22 
 
 		 947 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.943439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3187  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 192 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  44.44 
 
 		 810 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1393  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.18 
 
 		 99 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.912224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.44 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0774678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.44 
 
 		 680 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  45.24 
 
 		 791 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 147 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.712445  normal  0.0546768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0843  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 206 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.463441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0413  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.14 
 
 		 665 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.295225  normal  0.166033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0449  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.14 
 
 		 665 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 675 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0381  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 679 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2260  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  44.19 
 
 		 807 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 		 485 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3562  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3118  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.11 
 
 		 674 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.65 
 
 		 672 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 1013 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 		 138 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.45384  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1172  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 138 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1166  putative iron-sulfur binding protein  35.21 
 
 		 707 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421061  normal  0.487764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>